Esta fase que você cita é a da pré manutenção. Ele deixa claro no livro que essa fase é um preparo para quem quer fazer a dieta permanentemente, e já atingiu, ou falta perder apenas seus 2,5kgs finais. Ou seja essa medida é para quem quer continuar na dieta visando manter o peso alcançado anteriormente. Ele fala até que este aumento de 5g pode ser maior, para a pessoa ir testando o quanto ela pode aumentar os carboidratos, sem que a cetose deixe de atuar. E explica que aumentando os carboidratos, logo a pessoa perderá menos peso. Não seria justo usá-la para comparar com outra dieta (rica em carboidratos e pobre em gorduras), se você poderia perder muito mais peso mantendo os 20g de carboidratos diários (fase de indução) ou reduzindo.
Na parte grifada em vermelho por você, ele diz que não há necessidade de contar as calorias que isso não importa. E quando fala "Ganhar peso resulta de tomar mais calorias do que você gasta através de exercícios, termogênese (a produção do corpo próprio calor) e outras funções metabólicas", deve estar se referindo a outras dietas. Leia de novo, não dá pra separar do contexto em que foi escrito né? Durante o livro todo ele defende que as calorias não são importantes, mas que a saciedade da dieta se encarregará pela diminuição das calorias. Só que as calorias não são uma preocupação rigorosa, como numa dieta de calorias(onde se contam as calorias e gorduras ingeridas).