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Resumindo o assunto do tópico:
 
Crossfit pode sim gerar hipertrofia, já que se faz o treinamento com pesos, bw, etc, porém não se pode afirmar que ele gera hipertrofia da mesma forma que a musculação, afinal apesar das semelhanças, os esportes não tem o mesmo objetivo.
 
Se o autor quer saber se fazendo apenas crossfit pode ter hipertrofia a resposta é SIM.
 
Agora se ele quer saber se o resultado (hipertrofia) será o mesmo que poderia ser gerado para a musculação, a resposta é NÃO.
 
Aprofundando um pouco mais como o @Stein fez, se você levar em conta a performance e os riscos, de fato crossfit se torna menos atraente ainda para quem busca hipertrofia... afinal, estatísticas são estatísticas ... apesar de na sua escola de "70 alunos" não ter ocorrido (ainda), pode ter certeza que que treina realmente pesado tem grandes chances de lesão, até mesmo porque nem todo mundo tem experiência e técnica apurada... apenas força e é bem ai que mora o perigo.
 
 
 
 

Se nao gosta da musculação, vai pro crossfit, ele gera hipertrofia também.
So atente-se aos aquecimentos, alongamentos, pra evitar lesões como alertaram.
 
treino é igual dieta, o melhor é o que voce consegue seguir por mais tempo com prazer, num adianta fazer forçado que depois a motivação vai faltar.

Onde eu treino tem cerca de 70 alunos, de 15 a 63 anos. Nesses 4 meses não vi ninguém se lesionando.
É um treino diferente de musculação sim, assim como um treino de strongman ou treino de outro esporte.
É OUTRA COISA! Essa outra coisa gera hipertrofia caso faça dieta adequada. Foi isso que o autor do tópico perguntou.

Se o seu objetivo maior, for o ganho de massa magra, a melhor opção é a musculação, dieta correta e descanso.
 
Crossfit visa (segundo os criadores): resistência cardio-respiratória, resistência muscular, força, flexibilidade, potência, velocidade, coordenação, agilidade, equilíbrio e precisão.  Vale lembrar que tudo que vise força e potencia, trás riscos moderados a lesões a quem tem um certo condicionamento baixo. Esses circuitos são muito usados por Exércitos e Polícias, não é um treino (simples) muito indicado pra iniciantes (musculatura mais frágil). 
 
Motivação é algo supervalorizado hoje em dia, se tu tem um objetivo, não precisa ter um sorriso pra ir treinar, apenas FOCO!

Cara, ante de mais você tem de definir seu objetivo. Você quer ganhar massa magra, pronto. Mas prefere um corpo esculpido, simétrico estilo mens physique, ou um shape mais volumoso, com pouco detalhe no pormenor?
Se a resposta é a opção 1 então escolha um treino somente virado para hipertrofia. ABC2x, ABCDE, conciliando low e high reps, tempo sobre tensão, conexão músculo-mente, falha concêntrica, técnicas avançadas -drop, giant, tri sets-, etc etc
 
Se a resposta é a opção 2 então siga pelo crossfit. É bastante funcional, coisa que vc adquire raramente na musculação. Você vai ganhar uma boa quantidade força para levantar cargas consideráveis em movimentos como o snatch ou o clean and jerk.
 
Agora não espere ter um shape foda digno de capa de revista com crossfit. Basta ver o shape dos crossfitters por aí (cintura larga) e a forma como eles executam certos movimentos (pull ups é o exemplo). Porque crossfit (tal como powerlifting e derivados) não se preocupa em atribuir o maior stress ao músculo alvo mas sim mover o peso do ponto A ao ponto B.