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Simplesmente continue fazendo o agachamento o mais profundo que conseguir sempre, que com o tempo você terá flexibilidade o suficiente.

Especificidade é tudo, se você quer aprender a agachar, simplesmente agache, não use outras variações.
Uma das melhores coisas que você pode fazer é realizar o agachamento livre e pausar o máximo de tempo que conseguir lá embaixo, no seu limite. Mantenha o core contraído o tempo todo!
Com o tempo você conseguirá ir cada vez mais fundo.

Também trabalhe na sua mobilização, pesquise no youtube por mobilitywod e veja todos os vídeos que tenham "squat" no título.
Umas 2 semanas de trabalhos diários acredito que seja suficiente, difícil precisar de mais tempo do que isso para aprender a agachar.