Queen,
O EA pode até impedir a ovulação, mas não sei se isso ocorre, pois quem impede a ovulação são os hormonios feminos, estrogenio e progesterona existentes nos anticoncepcionais, creio q os EA só contribuam para a desregulação do ciclo, ou seja, se for sexualmente ativa vc deve continuar utilizando anticoncepcionais durante o ciclo para sua segurança (pelo menos no quesito de não ter filhos....hehehe)
Mas respondendo sua pergunta: Você não precisa parar de usar os EA enquanto tiver "nesses dias", pode utilizar normalmente.