Rafael Urso

Qual o seu peso atual e BF?
Já praticou exercícios anteriormente? - Incluindo academia ou corrida?
Está utilizando um tenis de procedência confiável e de finalidade para corrida?
 
O fortalecimento sempre é recomendado, mesmo com algum problema local. Normalmente quem possui problemas de joelho, fazem exercícios específicos para fortalecimento.
 
Se voce de fato tem 20 anos, procure um ortopedista, estando tudo ok, é só uma questão de ajuste intensidade x frequência.
 
Muitas vezes vale mais voce correr todos os dias 1km e ir aumentando conforme o seu corpo for se adaptando a frequência x intensidade. Do que explosões em dias esporádicos, a não ser que você irá fazer algum teste especifico para isso.
 
Considere adicionar aos seus treinos, fortalecimento de canela/panturrilha e posterior de coxa.
 
Nos dias que ocorrerem as dores no joelho, verifique se a sua rotula ( parte frontal do joelho ) esta inchada. Adicione gelo no local ( com proteção óbvio ) e perna para cima durante 20 a 30m.
Evite ficar com a perna dobrada por muito tempo, seja sentado ou deitado e sempre priorize manter a perna mais reta possível.
 
Caso voce tenha algum problema na sua pisada, o ortopedista irá te recomendar tenis/palmilhas especificas. Pela sua idade é possível ainda reverter a pisada, caso seja esse o maior problema.
 
Corrida é de alto impacto para os joelhos, então saúde em 1º lugar sempre. Não precisa desistir, apenas vá adaptando conforme o desenvolvimento corporal for acontecendo.