Pô cara, eu acho que vale a pena vc tentar fazer musculação em casa. Comprei cimento, areia e brita, 20kg de cada e deve ter sido menos de 20 reais, mais um tubo de antena pra usar de barra e um pouco de mão de obra e criatividade dá pra treinar bem em casa só com pesos livres, se tiver uma boa condição financeira melhor ainda. Além disso comprei uma corda naval pra fazer aeróbicos de alta intensidade e uma argola Olimpica.
Mas respondendo a sua pergunta diretamente, vale a pena sim, já que menos gordura vai favorecer uma resposta hormonal melhor quando for treinar pra ganhar massa na academia.
Mas lembrando que: treino aeróbico sem nenhum tipo de treino anaeróbico (musculação por exemplo) vai causar perda de massa muscular também.