Gostaria de saber se o cálculo do gasto calórico de uma série, por exemplo: de remada, é feita durante a execução ou durante o treino contando até o descanso? Exemplificando, 60 minutos de musculação gasta em média entre 250 calorias a 500 calorias, mas o treino em que eu descanso menos entre as séries, quando eu faço treino conjugados, logo eu gasto mais calorias?

Medir o quanto você gasta com 100% de precisão é praticamente impossível.

O que dá pra fazer é controlar com um smartwatch que vai contabilizar o gasto calórico de acordo com os batimentos cardíacos durante o treino.

Quando você descansa entre uma série e outra, seu BPM baixa e a contagem diminui. Bastante simples.

Ou você pode utilizar uma calculadora pronta que estipula um gasto médio conforme a intensidade do seu treino: https://www.hipertrofia.org/blog/2019/04/29/calculadora-de-macros/ (Caso sua preocupação seja calcular o saldo calórico diário e não o gasto calórico unicamente do treino)

O GET é calculado através da TMB + TEF (nem todos incluem isso no cálculo) + gasto de atividades laborais, treinos, cardios, etc.

(Acho que isso que falei por último não era sua dúvida, mas vai como bônus)

Sempre vai ser estimado, meu velho. São muitas variantes envolvidas.

É estimado.

Se você estiver usando um compêndio de exercício físico o tempo de descanso deve ser subtraído da equação.