Qual a experiência de você com o myfitnesspal? Vale a pena utilizar o app, qual o nível de confiança daqueles números?

Deve funcionar bem, mas eu pessoalmente não gostei, por mais dificil que pareça ainda prefiro entrar no livro TBCA e procurar lá. Tem momentos que eu olho em 3, 4, 5 locais e ta tudo diferente as quantidades, que você honestamente não sabe bem o que seguir.

Minha dica é : Escolha um método e use apenas ele, independente da precisão dele a melhor forma de você fazer ajustes é sempre tendo as mesmas medições. Quando você troca de aplicativo ou método usado para determinado objetivo as vezes vai mudar alguns numeros mesmo sem você alterar nada, apenas pq lá ta escrito que X comida tem 10g carbo a mais do que a mesma comida em outro aplicativo. Então seu melhor guia é o método que você escolher + balança + espelho. Dependendo dos resultados você vai fazendo alterações, sempre usando mesmo método para não diferir demais e ficar complexo fazer pequenos ajustes.

Eu tenho usado nos últimos 7/8 meses. Acabei assinando a versão paga, apenas por conveniência.

Assim como qualquer outro app, você tem que ser critico com o que você está registrando em seu consumo calórico. O repositório de produtos é cadastrado pelos próprios usuários, então busque encontrar um cadastro correto e sempre use ele.

De quais números? Calorias dos alimentos ou do cálculo que fazem de gasto calórico?

Alimentos tu consulta múltiplas fontes e segue o padrão (a fonte que foge muito das demais você desconfia que está errado).

Conta de gasto calórico diário é no máximo estimativa. A maioria vai usar as equações clássicas... não é questão de confiar, porque nenhuma vai te dar algo 100% preciso. Qualquer calculadora, vai exigir registro e ajuste semanal.